Los goles de Estudiantes fueron marcados por José Luis Calderón (3), Diego Galván (2), Mariano Pavone y Pablo Lugüercio. ↑ González, José Luis (30 de junio de 2009). «Goleador para la historia». Ekiza disputó 21 partidos consecutivos como titular, que abarcan desde su debut hasta el final de liga, siendo la primera opción por delante de jugadores ya consolidados como Fernando Amorebieta y Mikel San José. Los 16avos de la Europa League se disputaron frente al Anderlecht belga, en el primer partido se empató a uno, camiseta chelsea 2022 con el gol de Mikel San José. Por el contrario, en enero de 2011 debutó otra nueva promesa, en este caso era un central de 22 años llamado Borja Ekiza, y al igual que Aurtenetxe, también se hizo con la titularidad absoluta desde el primer partido. 3 de marzo, el Barcelona venció al Sporting de Gijón con un resultado de 3-1 a pesar de haber jugado con 10 hombres por más de media hora luego que Piqué fuese expulsado al inicio de la segunda mitad. El primer partido se jugó en el Camp Nou con resultado de empate a cero. En la semifinal de la copa el Athletic debía enfrentarse de nuevo contra el Sevilla F. C. con el resultado en contra de la ida (2-1), que hacía más difícil, si cabe, pasar la eliminatoria.
En los siguiente partidos, el mal sabor de boca dejado por el equipo durante la pretemporada se esfumó al ver como el Athletic ganaba y a la vez ofrecía un bonito juego que los sufridores aficionados agradecían. Ligeras diferencias para que los falsificadores se equivoquen y tengan que tirar el estraperlo chino, ganar un poco de tiempo. Poco antes de terminar el mercado de verano el Athletic consiguió también hacerse con la cesión de Asier del Horno por parte del Valencia C. F. para la nueva temporada. Poco más de un año después de su llegada al club, las negociaciones han fructificado. Hasta el momento son 20 los jugadores de San Lorenzo convocados para disputar una Copa Mundial de Fútbol mientras jugaban en el club, 17 disputaron la competición con la Selección Argentina y 3 lo hicieron representando a otro país. Como en ocasiones anteriores, la llegada y el declive o traspaso de un buen grupo de jugadores marcarían una etapa. La temporada 2009/10 fue una temporada de sucesiones, que estuvo marcada por las despedidas de viejas glorias y la llegada de jóvenes promesas.
Durante esta temporada se consolidaron en el primer equipo jugadores como Iker Muniain y Ander Iturraspe, el primero de ellos firmó un contrato con el primer equipo hasta 2015, convirtiéndose en una de las grandes promesas del nuevo Athletic. El día del partido varias peñas y aficionados del Athletic organizaron distintos eventos para entrar en ambiente de cara al partido. En el mercado de invierno el Athletic fichó al veterano portero del Cádiz Club de Fútbol, Armando Ribeiro, quien llegaría a Bilbao con 37 años de edad para vivir una «segunda juventud» en el Athletic. En el sorteo de la liguilla de la Europa League, al Athletic le tocó jugársela contra el FK Austria Viena, el C. D. Nacional y el SV Werder Bremen. En la jornada 37º selló definitivamente la clasificación a la Europa League y, una jornada más tarde, se afianzó en la 6º plaza, consiguiendo así el pase directo al play-off de la Europa League. Se clasificó para la UEFA Europa League sin necesidad de superar una eliminatoria previa. El joven canterano de 18 años, ya había debutado con el primer equipo en la Europa League el año anterior, si bien fue el único partido que disputó con el equipo mayor durante dicha temporada.
El inicio de la temporada trajo una nueva promesa al equipo: Jon Aurtenetxe. Para la nueva temporada el objetivo era claro; clasificarse para Europa y llegar lo más lejos posible en la Copa del Rey, como así confirmaron dos de los tres capitanes del equipo; Andoni Iraola y Pablo Orbaiz. El Athletic decidió olvidar rápidamente lo sucedido y se centró en la liga, donde quería cumplir el objetivo de meterse de nuevo en puestos europeos. El 28 de febrero del 2009 tuvo lugar la ida de la semifinal de la copa, donde el Athletic cayó por 2-1 frente al Sevilla F. C.. La actuación de la selección italiana en la Copa Mundial de Fútbol de 2006, organizada en Alemania, estuvo acompañada por el pesimismo generado por los escándalos del Calciopoli. Caparrós, descontento con la actuación de Dani Aranzubia bajo los palos, dio la titularidad al recién llegado Armando, el cual jugó como titular el resto de la temporada. Los bilbaínos vencieron al R. C. D. Espanyol por 1-0, con una brillante actuación de Iker Muniain, que realizó un soberbio encuentro provocando los aplausos y la admiración del graderío, maravillado por la técnica y los regates del jugador navarro.
Este partido levantó tanta expectación entre los aficionados rojiblancos, que 1200 de ellos pasaron toda la noche al raso esperando que se abriesen las taquillas del estadio para poder comprar sus entradas. La temporada 2011/12 destacó por un comienzo dubitativo, pero pronto evolucionó y se convirtió en la que sería una de las temporadas más ilusionantes del club rojiblanco, en gran parte gracias al fútbol combinativo propuesto por Marcelo Bielsa. En la temporada 2008/09 el Athletic hace realidad una utopía en sus 110 años de historia; por primera vez en su historia lucirá formalmente en liga y copa publicidad en sus primeras equipaciones. Se contabilizaron un total de 22 176 votos, lo que supuso el 65,49 % de participación de los socios con derecho a voto, alcanzando así la máxima participación de la historia del Athletic. Durante la primera vuelta de la Liga, el Athletic se mantuvo entre el 7º y el 11º puesto, pero sin llegar a alcanzar los puestos que daban acceso a competición europea. Esto se debió a que su rival, el Trabzonspor turco, fue llamado para llenar el hueco del Fenerbahçe, también turco, expulsado por supuesto amaño de partidos.